Open Box with STAT

基本的な統計学と疫学的手法,それらの文献等,R等の統計ソフトの使い方をブログ記事やYoutubeを用いて解説します.

その研究で何が知りたいのか? Estimandの話。

ある処置(介入や曝露)がアウトカムに影響あるか知りたいときは因果推論をしますよね。解析方法として、「多変量解析よりも傾向スコア使う方が良いんでしょ?」とよく耳にしますが、そうではありません。この記事では、解析方法はいろいろあるけど、「どの…

よく使うR パッケージ(package)集

おすすめのR packageをまとめました。

データ解析に役立つおすすめR本とサイト

データ解析に役立つおすすめR本とサイトをまとめました。

『Causal inference: What if』のまとめページ(Part III)

このPartでは,Time-varyingな状況下,つまり複数時点の曝露もしくは介入,および共変量の情報があり,ある時点の曝露(介入)が共変量や次の時点の曝露(介入)に影響を与えていく状況で,因果推論する方法を説明しています. 従来の解析手法(層別化や回帰…

『Causal inference: What if』のまとめページ(Part II)

このPartでは,Time-fixedな状況下,つまり曝露もしくは介入,および共変量が一時点の情報しかない状況で,モデルを利用して因果推論する方法を説明しています.生存時間解析のChapterもあります.Cox比例ハザードモデルを使わず,ロジスティック回帰モデル…

『Causal inference: What if』のまとめページ(Part I)

Part I: Causal inference without models では,シンプルな状況下で,因果推論の考え方,条件,方法を説明しています.

『Causal inference: What if』のまとめページ(はじめに)

『Causal inference: What if』のまとめページです.資料や動画を置いてます.

Clinical Question整理のためのRoadmap

臨床研究には,PECO or PICOで整理できないCQがあります.まず,記述・予測・因果推論でCQを分類し,その後,構造化することを提案します.

医学統計学(基本)1-2:点推定と区間推定(標準誤差・信頼区間)

標本で統計量で母集団の統計量を推定します.点推定とは未知の母数を1つの値で推定すること.区間推定とは点推定のばらつきを表したものです.95%信頼区間は点推定値の精度と捉えましょう.

医学統計学(基本)1-1:母集団と標本

統計学は,目の前のデータのありのままの姿を伝える記述統計と目の前のデータから背後のデータの特徴を推定する推測統計の2つに大きく分けることができます. この回から始まる医学統計学(基本)シリーズでは,推測統計に焦点を当てて勉強していきます.扱…

データサイエンスの分類

因果推論を軸にして,データサイエンスのこれまでとこれからを考えていきます.データサイエンスは,Description(記述)・Prediction(予測)・Counterfactual prediction(反事実予測)の3つに分類できます.また,どの分類でも専門家の知識は必要であり,…

Modern epidemiologyより,疫学へのベイズ統計の導入

Modern epidemiology読書会の私の発表資料と動画をアップします! 最近話題のベイズ統計モデリングとは異なり,「疫学へのベイズ統計の導入」を焦点に話を進めています. www.youtube.com speakerdeck.com

疫学統計セミナー2:疾病の発生の測定(発生割合,オッズ,発生率,有病率)

疫学統計セミナーをはじめました. 2回目の資料や動画をアップしています! 疾病の発生の要約方法である,発生割合,オッズ,発生率,および有病率について説明しています. www.youtube.com speakerdeck.com 今後も引き続き更新していきます.

疫学統計セミナー:データ解析と研究目的との関連

疫学統計セミナーをはじめました. 1回目の資料や動画をアップしています! 以前のブログ記事と同様にハーバード 大学のMiguel教授の論文を参考に,データサイエンスでできることを「記述」,「予測」,「因果推論」の3つに分類し,解説しています. (Migue…

Rmarkdownのすすめ

Rmarkdownを使えば,コードとその結果,コメントを一つのファイルにまとめることにできます. 私が考えるRmarkdownの良いところは,次の3つです. 1. データ解析の再現性を保てる 2. データ解析結果を共有する人に合わせて,出力する情報量を調整できる 3. …